Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Ekstrem Habitatlar MikrobiyolojisiMBG413235300
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz, Bahar
Dersin Diliİngilizce, Türkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüHilal AY
Dersi Veren(ler)Hilal AY
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBu dersin amacı ekstrem fizikokimyasal özelliklere sahip habitatların mikrobiyal biyoçeşitliliğinin ve bu tür habitatlara adaptasyon için mikroorganizmaların geliştirdiği moleküler adaptasyon mekanizmalarının anlaşılmasını sağlamaktır.
Dersin İçeriğiEktremofillere genel bakış, Termofiller, Psikrofiller, Asidofilik ve alkalifilik mikroorganizmalar, Halofiller, Piezofiller, Kserofiller, Radyasyona dirençli mikroorganizmalar, Oligotroflar, Ektrem habitatlara adaptasyon mekanizmaları
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Alam, M., & Tiwary, B. K. (Eds.). (2023). Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Bentham Science Publishers.
  • Durvasula, R. V., & Rao, D. S. (Eds.). (2018). Extremophiles: From biology to biotechnology. CRC Press.
  • Rainey, F. A., & Oren, A. (2006). Extremophiles. In Methods in Microbiology (Vol. 35, pp. 1-25). Academic Press.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Ekstremofilleri birincil stres toleransına göre sınıflandırarak ekolojik ve biyoteknolojik önemlerini özetleyebileceklerdir.
  2. Ekstrem habitatlarda hayatta kalmayı sağlayan temel moleküler ve hücresel adaptasyonları açıklayabileceklerdir.
  3. Ekstremofillerle ilgili literatürü eleştirel bir şekilde değerlendirerek adaptasyon stratejilerini ve potansiyel sınırlamaları destekleyen kanıtları belirleyebileceklerdir.
  4. Ekstremofil mikroorganizmaların izolasyonu için stratejiler geliştirebileceklerdir.
  5. Ekstremofil mikroorganizmaların genomik analizini yapabileceklerdir.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4DÖÇ-5
PÇ-155555
PÇ-2-----
PÇ-344455
PÇ-4-----
PÇ-5-----
PÇ-6-----
PÇ-7-----
PÇ-8-----
PÇ-9-----
PÇ-1055555
PÇ-11-----

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Konu Anlatımı: Ekstremofillere Giriş Sınıf-içi tartışma (15 dk): Mikroorganizmaların tolere edebildiği ekstrem fizikokimyasal özellikler ile ilgili örneklerEkstremofiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Ekstremofiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
2Konu Anlatımı: Hipertermofiller Sınıf-içi tartışma (15 dk): Hipertermofil mikroorganizmaların yaşam alanları ve uygulama alanları ile ilgili örnekler Sınıf-içi uygulama (60 dk): Hipertermofillerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiHipertermofiller: Çeşitlilik ve Adaptasyon konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Derin Deniz Vent Ekstremofilleri konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
3Konu Anlatımı: Psikrofiller Sınıf-içi tartışma (15 dk): Soğuğa adaptasyon ile ilgili hücresel mekanizmaların tartışılması Sınıf-içi uygulama (60 dk): Psikrofillerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiPsikrofiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Psikrofillerin Fizyolojik ve Biyokimyasal Adaptasyonları konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
4Konu Anlatımı: Asidofil Mikroorganizmalar: Çeşitlilik ve Adaptasyon Sınıf-içi tartışma (15 dk): Asidik ortamlarda yaşayabilen mikroorganizmalara örnekler verilmesi Sınıf-içi uygulama (60 dk): Asidofil mikroorganizmalarla ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiAsidofilik Mikroorganizmalar konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Ekstremofil Enzimler ve Biyoteknoloji konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
5Konu Anlatımı: Alkalifiller Sınıf-içi tartışma (15 dk): Yüksek pH ortamlarına adaptasyonla ilgili hücresel mekanizmaların tartışılması Sınıf-içi uygulama (60 dk): Alkalifillerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiAlkalifiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Ekstremofiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
6Konu Anlatımı: Halofilik Mikroorganizmalar Sınıf-içi tartışma (15 dk): Yüksek tuz konsantrasyonuna karşı mikroorganizmaların sahip olduğu hücresel mekanizmaların tartışılması Sınıf-içi uygulama (60 dk): Halofilik mikroorganizmalarla ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiHalofilik Mikroorganizmalar konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Halofilik ve Haloalkalifilik Aktinobakterilerin Biyolojisi ve Uygulamaları konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
7Konu Anlatımı: Piezofiller Sınıf-içi tartışma (15 dk): Yüksek basınca dayanıklı mikroorganizmaların sahip olduğu hücresel mekanizmalar Sınıf-içi uygulama (60 dk): Piezofillerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiPiezofiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Derin Deniz Vent Ekstremofilleri konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
8Ara Sınav 1
9Konu Anlatımı: Kserofiller Sınıf-içi tartışma (15 dk): Kurak ortamlara adaptasyonla ilgili hücresel mekanizmaların tartışılması Sınıf-içi uygulama (60 dk): Kserofillerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiKserofiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Çöl Ekosistemlerinin Ekstremofil Çeşitliliği ve Biyoteknolojik Uygulamaları konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
10Konu Anlatımı: Radyasyona Dirençli Mikroorganizmalar Sınıf-içi tartışma (15 dk): Radyoaktif ışınların mikroorganizmalar üzerine etkilerinin tartışılması Sınıf-içi uygulama (60 dk): Radyasyona dirençli mikroorganizmalarla ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiRadyasyona Dirençli Mikroorganizmalar konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Ekstremofiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
11Konu Anlatımı: Metallofiller Sınıf-içi tartışma (15 dk): Ağır metal toleransına sahip mikroorganizmaların biyoteknolojik kullanım alanlarının tartışılması Sınıf-içi uygulama (60 dk): Metallofillerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiMetallofiller ve Ağır Metal Biyoremediasyonu konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Ekstremofiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
12Konu Anlatımı: Oligotrof Mikroorganizmalar /Ara sınav 2Oligotroflar konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Ekstremofiller konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology. Sınav haftasına kadar işlenen konuların tümünün tekrar edilmesi
13Konu Anlatımı: Ekstremofillerin İzolasyonları ve Biyoteknolojik Uygulamaları Sınıf-içi tartışma (15 dk): Ekstrem habitatlardan mikroorganizma izolasyonu için izlenebilecek yöntemlerin tartışılması Sınıf-içi uygulama (60 dk): Ekstremofil mikroorganizmaların izolasyon yöntemleri ve biyoteknolojik kullanımları ile ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiEkstremofillerin Uygulama Alanları konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Ekstremofil Enzimler ve Biyoteknoloji konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
14Konu Anlatımı: Ekstremofil Aktinobakteriler Sınıf-içi tartışma (15 dk): Aktinobakterilerin kurak ortamlara adapte olmalarını sağlayan özelliklerinin tartışılması Sınıf-içi uygulama (60 dk): Aktinobakterilerin izolasyon yöntemleri ile ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiEktremofillere Giriş konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Halofilik ve Haloalkalifilik Aktinobakterilerin Biyolojisi ve Uygulamaları konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
15Konu Anlatımı: Ekstremofiller ve Genomik Sınıf-içi tartışma (15 dk): Mikrobiyal genomlarda ekstrem habitat adaptasyonu ile ilgili özelliklerin anotasyonu Sınıf-içi uygulama (60 dk): Mikrobiyal genomik analizle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiEktremofillere Giriş konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles: Diversity, Adaptation and Applications. Ekstremofil Çalışmaları konusunun okunması. Kaynak: Extremophiles - From Biology to Biotechnology.
16Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama1420
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev
Sunum/Jüri
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar240
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama141
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması103
Derse Özgü Staj
Ödev
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)220
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok