Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Mikrobiyal Sekonder MetabolitlerMBG414235300
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz, Bahar
Dersin Diliİngilizce, Türkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüHilal AY
Dersi Veren(ler)Hilal AY
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBu dersin amacı öğrencilerin mikrobiyal primer ve sekonder metabolizma hakkında bilgi edinerek mikrobiyal sekonder metabolitlerin biyoteknolojik uygulamaları hakkında bilgi edinmelerini sağlamaktır.
Dersin İçeriğiMikrobiyal metabolizmaya giriş, Bakteriyal sekonder metabolitler, Fungal ve liken sekonder metabolitleri, Biyoaktif sekonder metabolitler, Sekonder metabolit yapıları,Sekonder metabolizmanın düzenlenmesi, Mikrobiyal sekonder metabolitlerin tıbbi kullanımları, Mikrobiyal sekonder metabolitlerin gıda ve tarımda kullanımı, Mikrobiyal sekonder metabolitlerin endüstriyel kullanımı, Yeni mikrobiyal sekonder metabolitlerin keşfi için stratejiler.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • E. Rosenberg, E.F. DeLong, S. Lory, E. Stackebrandt, F. Thompson. The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology (2013). Springer-Verlag Berlin Heidelberg.
  • Wink, J., Mohammadipanah, F., & Hamedi, J. (Eds.). (2017). Biology and biotechnology of actinobacteria. Cham, Switzerland: Springer International Publishing.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Mikrobiyal metabolizma, primer ve sekonder metabolizma kavramlarını tanımlayabileceklerdir.
  2. Farklı kimyasal sınıflara ait mikrobiyal sekonder metabolitleri ayırt edebileceklerdir.
  3. Mikrobiyal metabolitlerin biyoteknolojik kullanım alanlarını yorumlayabileceklerdir.
  4. Mikrobiyal sekonder metabolitlerin üretim teknolojilerini karşılaştırarak mikrobiyal sekonder metabolit keşfi için stratejiler geliştirebileceklerdir.
  5. Biyoinformatik araçlar kullanarak mikrobiyal sekonder metabolit kodlayan gen kümelerini tanımlayabileceklerdir.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4DÖÇ-5
PÇ-155555
PÇ-2-----
PÇ-3-----
PÇ-4-----
PÇ-555555
PÇ-6-----
PÇ-7-----
PÇ-8-----
PÇ-9-----
PÇ-1055555
PÇ-11-----

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Konu Anlatımı: Mikrobiyal Metabolizmaya Genel Bakış Sınıf-içi tartışma (15 dk): Primer ve sekonder metabolizma kavramlarının tartışılmasıThe Metabolic Pathways of Biodegradation. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology Introduction. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
2Konu Anlatımı: Mikrobiyal Sekonder Metabolizmanın Düzenlenmesi Sınıf-içi tartışma (15 dk): Sekonder metabolit üretimini uyaran hücresel mekanizmalara örnekler verilmesi Sınıf-içi uygulama (60 dk): Mikrobiyal sekonder metabolitlerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiBacterial Pharmaceutical Products. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology The Role of Actinobacteria in Biotechnology. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
3Konu Anlatımı: Mikrobiyal Biyoaktif Metabolitler Sınıf-içi tartışma (15 dk): Mikroorganizmalardan elde edilen antibiyotik, antikanser vb. ilaçlara örnekler verilmesi Sınıf-içi uygulama (60 dk): Biyoaktif metabolitlerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiBacterial Pharmaceutical Products. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology The Role of Actinobacteria in Biotechnology. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
4Konu Anlatımı: Bitki Gelişimini Destekleyici Bakteriler Sınıf-içi tartışma (15 dk): Biyolojik gübre ve mikrobiyal biyokontrol ajanlarının tartışılması Sınıf-içi uygulama (60 dk): PGPB ile ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiDiversity and Biotechnological Applications of Prokaryotic Enzymes. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology Ecology and Habitat Distribution of Actinobacteria. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
5Konu Anlatımı: Fungal Biyoaktif Metabolitler Sınıf-içi tartışma (15 dk): Funguslardan elde edilen antibiyotiklere örnekler verilmesi Sınıf-içi uygulama (60 dk): Funguslardan izole edilen biyoaktif metabolitlerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiBiodeterioration. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology Symbiosis and Pathogenicity of Actinobacteria. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
6Konu Anlatımı: Mikrobiyal Peptidler ve Biyoteknolojik Uygulamaları Sınıf-içi tartışma (15 dk): Peptit yapıdaki antibiyotiklerin kullanım alanlarına örnekler verilmesi Sınıf-içi uygulama (60 dk): Biyoaktif peptitlerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiAmino Acid Production. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology The Role of Actinobacteria in Biotechnology. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
7Konu Anlatımı: Mikrobiyal Poliketidler ve Biyoteknolojik Uygulamaları Sınıf-içi tartışma (15 dk): Poliketid yapıdaki antibiyotiklere örnekler verilmesi Sınıf-içi uygulama (60 dk): Biyoaktif poliketidler ile ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiBacterial Pharmaceutical Products. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology Physiology of Actinobacteria. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
8Ara Sınav 1
9Konu Anlatımı: Mikrobiyal Terpenler ve Biyoteknolojik Uygulamaları Sınıf-içi tartışma (15 dk): Mikrobiyal terpenler ve ekosistemdeki işlevleri ile ilgili tartışma Sınıf-içi uygulama (60 dk): Biyoaktif terpenlerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiBacterial Pharmaceutical Products. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology Physiology of Actinobacteria. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
10Konu Anlatımı: Mikrobiyal Pigmentler ve Biyoteknolojik Uygulamaları Sınıf-içi tartışma (15 dk): Mikroorganizmalardan elde edilen melanin, karoten, fleksirubin vb. pigmentlerin biyoteknolojik kullanımları ile ilgili örnekler verilmesi Sınıf-içi uygulama (60 dk): Mikrobiyal pigmentlerin biyoteknolojik kullanımıyla ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiBacteria in Food and Beverage Production. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology The Role of Actinobacteria in Biotechnology. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
11Konu Anlatımı: Mikrobiyal Sekonder Metabolitlerin Endüstriyel Üretimi Sınıf-içi tartışma (15 dk): Büyük-ölçekli sekonder metabolit üretiminde optimizasyon ile ilgili tartışma Sınıf-içi uygulama (60 dk): Biyoreaktörlerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiOrganic Acid and Solvent Production. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology Practical Aspects of Working with Actinobacteria. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
12Konu Anlatımı: Mikrobiyota ve İnsan Sağlığı / Ara sınav 2Microbial Biofilms. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology Post-genomic Studies and Systems Biology of Actinobacteria. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria Sınav haftasına kadar işlenen konuların tümünün tekrar edilmesi
13Konu Anlatımı: Aktinobakteriler Sınıf-içi tartışma (15 dk): Aktinobakterilerin biyoteknolojik önemi ile ilgili örnekler Sınıf-içi uygulama (60 dk): Aktinobakterilerden elde edilen biyoaktif metabolitlerle ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiBacterial Pharmaceutical Products. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology The Genetic System of Actinobacteria. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
14Konu Anlatımı: Yeni Mikrobiyal Sekonder Metabolitlerin Keşfi ve Genomik Sınıf-içi tartışma (15 dk): Sekonder metabolit biyosentez gen kümelerinin tespiti için kullanılan programlara örnek verilmesi Sınıf-içi uygulama (60 dk): Sekonder metabolit kodlayan genlerin biyoinformatik analizi ile ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiDiversity and Biotechnological Applications of Prokaryotic Enzymes. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology Post-genomic Studies and Systems Biology of Actinobacteria. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
15Konu Anlatımı: Mikrobiyal Metabolitler ve Genetik Mühendisliği Sınıf-içi tartışma (15 dk): CRISPR-Cas yöntemi ile sekonder metabolit üretiminin artırılması ile ilgili tartışma Sınıf-içi uygulama (60 dk): Gen mühendisliği yöntemleri ile mikrobiyal sekonder metabolit üretiminin iyileştirilmesi ile ilgili seçilen makale ve derlemeler üzerine soru-cevap etkinliğiDiversity and Biotechnological Applications of Prokaryotic Enzymes. Source: The Prokaryotes: Applied Bacteriology and Biotechnology The Genetic System of Actinobacteria. Source: Biology and Biotechnology of Actinobacteria
16Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama1420
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev
Sunum/Jüri
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar240
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama141
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması103
Derse Özgü Staj
Ödev
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)220
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok