Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Biyoinformatiğe GirişMBG312235220
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin Diliİngilizce, Türkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüZorunlu @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüNehir Özdemir Özgentürk
Dersi Veren(ler)
Asistan(lar)ıEmre Aktaş
Dersin AmacıBiyoinformatiğin temel prensipleri ve kullanım alanları ve biyoinformatik temel araçlarının kullanımı hakkında bilgi kazandırmak
Dersin İçeriğiBiyoinformatik kavramı ve kullanım alanları, bilginin toplanması, işlenmesi ve paylaşılması, veri bankalarının kullanımı, protein ve nükleotid veri tabanlarının incelenmesi, primer dizaynı, nükleotid dizi analiz sonuçlarının değerlendirilmesi
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Uygulamalı Biyoinformatik: Giriş - Alıştırmalar ve Çözümleri ile Birlikte Paul M.Selzer, Richard J.Marhöfer, Oliver Koch Genomik Analiz İçin Biyoinformatik Yöntemler Muhammet Şakiroğlu
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Biyoenformatik kullanım alanlarını öğrenme ve bir problem karşısında çözüm önerme becerisi
  2. Temel ve en çok kullanılan biyoinformatik araçlarını kullanma becerisine sahip olmak
  3. Yeni gelişen teknolojileri takip etmek için temel öğrenme becerilerini kazanmak
  4. Biyolojik verileri analiz etme ve yorumlama becerisi kazanmak
  5. Çevrimiçi biyoinformatik araçları kullanma becerisini edinmek

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4DÖÇ-5
PÇ-1-----
PÇ-2-----
PÇ-3-----
PÇ-4-----
PÇ-5-----
PÇ-6-----
PÇ-7-----
PÇ-8-----
PÇ-9-----
PÇ-10-----
PÇ-1155555
PÇ-12-----
PÇ-13-----
PÇ-14-----
PÇ-15-----
PÇ-16-----
PÇ-17-----
PÇ-18-----

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Biyoinformatik Nedir? Biyoinformatik kullanım alanlarıİlgili kaynaklar
2Moleküler Veri Depolama ve işlemeİlgili kaynaklar
3Makale tarama/ uygulamasıİlgili kaynaklar
4Nükleotid veri tabanlarıİlgili kaynaklar
5Protein veri tabanlarıİlgili kaynaklar
6BLAST ile dizi benzerliği sorgulamaİlgili kaynaklar
7BLAST ile dizi benzerliği sorgulamaİlgili kaynaklar
8Ara Sınav 1
9Çoklu Dizi Hizalamaİlgili kaynaklar
10Genom Dizilemeİlgili kaynaklar
11Genom anotasyonuİlgili kaynaklar
12Genom anotasyonuİlgili kaynaklar
13Primer tasarımıİlgili kaynaklar
14DNA motifi tayin algoritmalarıİlgili kaynaklar
15Çevrimiçi biyoinformatik araçlar
16Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama130
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev
Sunum/Jüri
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar130
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati142
Laboratuar
Uygulama142
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması143
Derse Özgü Staj
Ödev
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)125
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok